Question

我的问题可能不如标题所建议的那样笼统。我正在MySQL数据库MacOS X上运行,以储存数据。一段时间以来,我一直在与科米多·科米斯-里合作。最近,我需要自动生成的报告,并检查了Souave。 I guess StatET / Eclipse似乎是Siervers的“标准”解决办法。

(1) 从科米多向StatET Eclipse转变是否合理? 此前,我曾尝试过StatET,但选择了Komodo在StatET,因为我喜欢叫喊叫/汽车,而从科米多说,会更方便。

2) 产生Sierave档案的合理工作流程是什么? 我通常首先制定我的《区域法典》,然后在晚些时候关注报告。我今天刚刚获悉,在瑞典有一个文件,一度载有《劳动法》和《快乐法》,而从这一档案中产生了“顶”文件。举例来说,这些档案可以直截了当,无法真正想象如何将我250+线的R代码输入档案,并将之与后期混在一起。

是否有可能仅仅将qplot()和ggplot()的发言输入这种文件,并介绍数据库连接和中间结果等功能?

还是仅仅把它用于过时和过时的法典?

任何建议、背心、联系和背对根hout......

Answer 1

您提出了几个问题,因此,这里有几个答案。

难道StatEt/Eclipse the right way to do Sweave ?

通常(注:I m avid StatEt/Eclipseuser, and use it for both R and Sweave/R and care it, In t used Komodo / sciviews-R)。你们应该能够从任何R指挥线上管理勇敢的指挥,这将产生立案。之后,你可以将t子从任何茶叶环境中转成可以读(如pdf)。

哪些工作流程良好?

当我想把手稿变成一份勇敢的报告时,我从一个空洞的彩虹模板开始,把我的整个手稿复制/剪辑到标题之后的一个勇敢的R块,即:

<<label=myEntireRScript, echo=false, include=false>> 
#Insert code here
myTable<-dataframe(...)
myPlot<-qplot(....)
@

然后,我去找我想要报告的部分。例如,如果想把表格列入报告,我就会切断R块,在变数和地块中设置一个可变的块块,而相同。

<<label=myEntireRScript, echo=false, include=false>>=  
#Insert code here
@ 
Put any text I want before my table here, maybe with a Sexpr{print(variable)} named variable

<<label=myTable, result=Tex>>= 
myTable<-dataframe(...)
print(xtable(mytable,...),...)
@ 
Any text I want before my figure
<label=myplot, result=figure>>= 
myPlot<-qplot(....)
print(qplot)
@

Answer 2

您不妨查看https://stackoverflow.com/questions/3153705/带-started-with-sweave-eclipse-and-r>these 、。我的其余职位涉及问题2。

在用瑞典语编写报告时,我通常将大多数区域法典和报告案文分开。如果《区域法典》能够迅速运行,那么我更喜欢在《法典》一开始就包括如下内容。 Rnw文档:

<<>>
source( /path/to/script.r )
@

另一方面,如果《区域法典》需要很长的时间,我通常会包括以下内容:

Sweave( /path/to/report.Rnw ); system( pdflatex report.tex )

这样,我就能够迅速重新提出这份报告,而无需再次执行《区域法典》。然后,R必须在Sierave档案中做的唯一工作是印刷表格、制作图表和可能摘取一些数字。

Answer 3

同“无声”一样,我更希望将R和Sierave档案分开,但我更希望将工作空间与<代码>save.image(<>而不是source(<>>存档。这避免了每计算一次R。 Rnw案汇编(我总是以比我这样更重的分类来完成)。

我的一般工作流程是,在每一纸面/项目中,用自己的R文档进行。当计算方面为“单一”时,Isave.image(),以储存所有工作空间变量。

之后,在......。同一目录中的Rnw文档,用setwd(,并用load(>Rdata”)装载所有变量。当然,你可以改变你为你的工作空间所使用的名称,但我每双倍工作,并保留缺席的名称。 Oh,如果你用R文档,肯定能够挽救工作空间的形象,并观察工作空间和工作空间中的各种变量。 Rnw文档,但已不再是R文档的一部分......这就是save.image()办法可能造成一些头痛。

我在一份Mac和我的案文中建议,如果你真心y地重新.热,你会重新.热。我使用正文和指挥线R,但大多数情况下, em子/ess能发挥最佳作用。如果你回头 ha,我怀疑你为R、Sweave和LaTeX学习的助手/ess。

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